Мікробіологічна діагностика грунтів - про що «говорять» мікроби?
«Біологічний двигун планети», - так висловився Блоем Дж. Про грунтові мікроорганізми. Дійсно, бактерії беруть участь у кругообігу найважливіших елементів - азоту, фосфору, калію, вуглецю, вони забезпечують рослини поживними елементами, беруть участь в розкладанні органіки, тим самим забезпечуючи оборот грунтового органічної речовини.
У свою чергу, мікроорганізми засвоюють ексудати рослин - органічні речовини, що виділяються в процесі життєдіяльності кореневою системою рослин. Це органічні кислоти, амінокислоти і аміди, цукру, нуклеїнові кислоти, ферменти, вітаміни і гормони.
Рослини шляхом створення особливих умов за рахунок збагачення органічними речовинами грунту сприяють залученню мікроорганізмів, які швидко розмножуються всередині, на поверхні і з зовнішнього боку кореня. Все це може призвести і до небажаних для рослин ефектам: збільшення чисельності фітопатогенів (збудників хвороб, від грец. pathos - Страждання), розвитку конкуренції між рослинами і мікроорганізмами за поживні речовини, втрат елементів живлення за рахунок денітрифікації (для азоту) та іммобілізації (для фосфору).
Однак при взаємодії ґрунт-рослина-мікроорганізм існують природні механізми придушення фітопатогенів, як, наприклад, антібіоз - інгібування патогена антимікробними компонентами. Так, непатогенні види Streptomyces sp. здатні пригнічувати ріст парші картоплі, викликаної збудником Streptomyces scabies. Деякі види Arthrobacter sp., Pseudomonas sp. і Bacillus sp. здатні обмежувати ріст патогенних грибів.
Широко поширені в природі мікоризні асоціацію між грибами і корінням рослин. Мікоризні асоціації призводять до якісних змін в кореневих виділеннях рослин. Ексудати, що виділяються з колонізованих мікоризою коренів, можуть зменшувати утворення спор фітопатогенів Phytophtora sp. і навіть сприяти залученню в кореневу зону бактерій, які сприяють зростанню рослин - Azotobacter chroococcum і Pseudomonas fluorescens.
Кожен вид рослин за рахунок відмираючих кореневих волосків здатний частково забезпечувати субстрат для росту мікроорганізмів, збільшуючи грунтове біорізноманіття. Є у рослин і механізми регуляції чисельності бактерій і грибів. Так, люцерна і ячмінь здатні пригнічувати ріст патогена Sclerocinia sclerociorum, беручи тим самим участь в фітосанітарної очищення грунту.
На сьогоднішній день вченим стало ясно, що недостатньо вивчати мікроорганізми як «чорний ящик» на рівні вимірювання лише загальної чисельності і дихальної активності грунтів. Необхідні комплексні підходи до вивчення грунтового різноманіття. Сучасні методи грунтових досліджень дозволяють визначати до 50 видів мікроорганізмів в одному зразку. Стає можливим на основі аналізу структури мікробного співтовариства говорити про що відбуваються в грунті процесах починається деградації або гумусонакопленія і в цілому про «здоров'я» грунтів.
